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swiss model结果分析,iTASSER和swiss model

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【swiss model结果分析,iTASSER和swiss model】swiss-PDB浏览器如何显示二硫键？1. 。OverviewSwissPdbViewer也称为DeepView ， 其功能如下:a .显示和分析生物大分子的结构和图解；b .给出氨基酸序列，从零开始建立蛋白质结构模型c .发现并显示蛋白质、蛋白质和基团d之间的氢键，用晶体探测器探测电子密度图，判断电子密度图和模型的好坏，从而可以确定蛋白质模型中的许多常见缺陷；swiss model建模同源性较好，40%比较建模法是一种基于知识的蛋白质结构预测方法，也称同源结构预测，根据大量已知的蛋白质三维结构，预测序列已知但结构未知的蛋白质结构 。
1、蛋白质结构预测与 分析常用网址(中蛋白质三级结构的预测方法:1 。同源建模modeling 2 。foldrecognition3 。从头计算的abinitiomethod同源建模基本步骤:1 .模板选择；2.待测序列和模板序列之间的比较；3.模型的建立:①待测蛋白主链的构建；②线圈区域的建模；③侧链安装# SCWRL() ， 目前比较流行的侧链安装程序，4 。模型评估和周期细化 。
2、 swiss-pdbviewer如何显示二硫键 1 。。OverviewSwissPdbViewer也称为DeepView 。其功能如下:a .显示和分析生物大分子的结构和图解；b .给出氨基酸序列，从零开始建立蛋白质结构模型c .发现并显示蛋白质、蛋白质和基团d之间的氢键，用晶体探测器探测电子密度图，判断电子密度图和模型的好坏，从而可以确定蛋白质模型中的许多常见缺陷；
3、 swiss model建模同源性要多少比较好40%比较建模法是一种基于知识的蛋白质结构预测方法，也称同源结构预测 ， 根据大量已知的蛋白质三维结构 ， 预测序列已知但结构未知的蛋白质结构 。按照目前的定义，如果待建模的蛋白质与模板序列的sequenceidentity大于40%(有人认为大于35%)，那么它们的结构可能属于同一个家族，是同源蛋白质，可以通过同源蛋白质模型构建的方法预测它们的三维结构 。

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